Le GFCO à été créé en 1992 sur le modèle du GFCH (Groupe Français de Cytogénétique Hématologique). Il regroupe plusieurs laboratoires français impliqués dans la cytogénomiques des tumeurs solides.

Depuis 2008, il est un groupe de travail de l'ACLF (Association des Cytogénéticiens de Langue Française), elle même membre de la FFGH (Fédération Française de Génétique Humaine), regoupant toutes les associations françaises deÊ génétique humaine, association crée aussi en 2008.

Son but est de fournir lors de ses 3 réunions annuelles des occasions de rencontres entre cytogénéticiens hospitaliers, cliniciens et chercheurs. Elles sont l'occasion de confronter les résultats obtenus entre différents laboratoires, de discuter des points d'actualité et de mener des études coopératives.

La méthode de travail (révision indépendante de chaque dossier cytogénétique en groupe) est une garantie de qualité des résultats. Une démarche qualité spécifique au GFCO est une autre activité.

Des études spécifiques prospectives sont en cours: